Am Bahnhof in Lingen halten im Regionalverkehr die Züge der WestfalenBahn und im Fernverkehr die Intercity-Züge der Deutschen Bahn.
Die Züge der WestfalenBahn fahren stündlich auf der Linie RE15 zwischen Emden und Münster (Westf). Die Züge bieten einzeln 215 bzw. im 2er-Team bis zu 430 Sitzplätze, verfügen über einen stufenlosen Einstieg und sind barrierefrei gestaltet.
Über die Deutsche Bahn ist Lingen an das Fernverkehrsnetz angebunden. Auf der Strecke zwischen Emden und Köln verkehren die Intercity-Züge in der Regel alle zwei Stunden. Teilweise beginnen die Züge auch bereits in Norddeich Mole bzw. Emden Außenhafen.
